全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL

       摘要: 以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点.结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响.全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(qMRR9、qGL2、qGL10、qGW1、qGLWR1和qGLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL.此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效.结合前人研究结果,我们推论qSW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色.研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息.

作者:
方雅洁 朱亚军 吴志超 陈凯 申聪聪 石英尧 徐建龙
单位:
安徽农业大学, 安徽合肥 230036;中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081 中国农业科学院农业基因组研究所,广东深圳,518210 中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081 安徽农业大学,安徽合肥,230036 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081;中国农业科学院农业基因组研究所, 广东深圳 518210;中国农业科学院深圳生物育种创新研究院, 广东深圳 518210
出处:
《作物学报》
刊期:
2018年第44卷第1期
基金:
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014AA10A601) 农业部引进国际先进农业科学技术(948)项目(2016-X16) 深圳孔雀团队计划(20130415095710361) 中国农业科学院科技创新工程团队项目资助.

全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL

摘要:以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点.结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响.全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(qMRR9、qGL2、qGL10、qGW1、qGLWR1和qGLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL.此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效.结合前人研究结果,我们推论qSW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色.研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息.

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