摘要: 油菜籽饼粕是畜禽养殖中重要的蛋白原料, 但饼粕中的硫苷是一种抗营养物质, 食用过多会对禽畜产生毒害, 因此挖掘油菜籽粒硫苷含量的候选基因对油菜种子低硫苷育种具有重要现实意义.本研究连续4年种植1个含157份材料的油菜自然群体, 结合重测序数据对种子硫苷含量进行全基因组关联分析(GWAS), 并对15份低硫苷和15份高硫苷材料进行种子发育早期的转录组测序, 通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定种子硫苷含量的候选基因.用GWAS共检测到45个与种子硫苷含量显著相关的SNP, 单个位点解释的表型变异为13.5%~23.3%, 主要分布在A09、C02和C09染色体的3个区间中, 覆盖5个已知的硫苷代谢基因.用WGCNA分析发现高、低硫苷材料之间的2275个差异表达基因, 可分为12个基因模块, 其中1个模块的基因显著富集在已知的硫苷生物合成途径, 对该模块内163个基因的权重分析得到13个候选基因.经检测, GWAS和WGCNA共得到的18个候选基因中, 有14个候选基因的表达量与种子硫苷含量显著相关(r = 0.376~0.638, P<0.05).用两种方法鉴定到1个共同的候选基因BnaC02g41790D(基因名 MAM1),与该基因连锁的 5 个 SNP 构成 5 种单体型,等位基因效应分析发现,自然群体中63%的材料(99/157)为Hap 5, 平均硫苷含量为50.79 μmol g-1, 与另外4种单体型(95.04~110.28 μmol g-1)存在极显著差异(P<0.01).本研究结合 GWAS和 WGCNA两种方法鉴定了油菜种子硫苷含量的候选基因, 可为复杂性状候选基因的筛选提供参考.
摘要：油菜籽饼粕是畜禽养殖中重要的蛋白原料, 但饼粕中的硫苷是一种抗营养物质, 食用过多会对禽畜产生毒害, 因此挖掘油菜籽粒硫苷含量的候选基因对油菜种子低硫苷育种具有重要现实意义.本研究连续4年种植1个含157份材料的油菜自然群体, 结合重测序数据对种子硫苷含量进行全基因组关联分析(GWAS), 并对15份低硫苷和15份高硫苷材料进行种子发育早期的转录组测序, 通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定种子硫苷含量的候选基因.用GWAS共检测到45个与种子硫苷含量显著相关的SNP, 单个位点解释的表型变异为13.5%~23.3%, 主要分布在A09、C02和C09染色体的3个区间中, 覆盖5个已知的硫苷代谢基因.用WGCNA分析发现高、低硫苷材料之间的2275个差异表达基因, 可分为12个基因模块, 其中1个模块的基因显著富集在已知的硫苷生物合成途径, 对该模块内163个基因的权重分析得到13个候选基因.经检测, GWAS和WGCNA共得到的18个候选基因中, 有14个候选基因的表达量与种子硫苷含量显著相关(r = 0.376~0.638, P<0.05).用两种方法鉴定到1个共同的候选基因BnaC02g41790D(基因名 MAM1),与该基因连锁的 5 个 SNP 构成 5 种单体型,等位基因效应分析发现,自然群体中63%的材料(99/157)为Hap 5, 平均硫苷含量为50.79 μmol g-1, 与另外4种单体型(95.04~110.28 μmol g-1)存在极显著差异(P<0.01).本研究结合 GWAS和 WGCNA两种方法鉴定了油菜种子硫苷含量的候选基因, 可为复杂性状候选基因的筛选提供参考.
说明：如本页面涉及到版权问题或作者不愿意公开，请联系本站管理员删除！
| [1] | 尹丽玲 . 宫外孕围手术期患者应用全程护理干预的效果分析 [J]. 航空军医 ,2018,3 |
| [2] | 龚晴 . 使用全同步带状弓矫治器在早期前移下颌第二磨牙的临床观察 [J]. 航空军医 ,2018,14 |
| [3] | 彭岩 . 冠心病患者介入治疗中应用全局式护理的效果观察 [J]. 名医 ,2018,1 |
| [4] | 梁婷 . 小儿哮喘雾化吸入治疗应用全程护理干预的效果分析 [J]. 航空军医 ,2018,10 |
| [5] | 邓丹华 . 应用全面质量管理理论提升医院护理质量和管理水平 [J]. 航空军医 ,2018,12 |
| [6] | 李富新 . 老年股骨颈骨折应用全髋关节置换术和半髋关节置换术治疗的对比 [J]. 航空军医 ,2017,21 |
| [7] | 黄旭 . 中老年膝关节炎运用全膝关节置换治疗的观察 [J]. 航空军医 ,2017,19 |
| [8] | 罗娟 . 手术室优质护理中应用全程无缝护理模式的价值 [J]. 航空军医 ,2017,19 |
