4株海洋红球菌产类胡萝卜素分析及其全基因组测序

       摘要: 以源于东太平洋海水的4株红球菌分离菌Rhodococcussp.EPR-134、Rhodococcus sp.EPR-147、Rhodococcus sp.EPR-157和Rhodococcus sp.EPR-279为研究对象,开展了菌株的色素提取和色素全波长扫描,并基于全基因组测序分析了4株细菌类胡萝卜素代谢通路中的相关基因.色素全波长扫描结果显示,菌株EPR-134不具备类胡萝卜素产生能力,而其它3株红球菌能够产生类胡萝卜素,且所产类胡萝卜素组分不同.基因组分析表明,4个细菌基因组中存在较为完整的促使类胡萝卜素形成的基因簇.对菌株参与番茄红素形成的3个关键基因crtE、crt B和crtI的氨基酸序列同源性两两比对分析表明,菌株EPR-134 3个基因氨基酸序列与其它3个菌株相应基因氨基酸序列同源性最低,这可能是导致该菌株不产类胡萝卜素的关键原因.该研究结果为产类胡萝卜素红球菌的遗传改造,以及为产类胡萝卜素工程菌的构建奠定了前期基础.

作者:
张帝 张宁 陈吉刚 杨季芳
单位:
上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100 浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波,315100
出处:
《海洋学研究》
刊期:
2016年第34卷第4期
基金:
国家海洋公益性行业科研专项项目资助 宁波市科技公关重大项目资助 浙江省重中之重学科学生创新计划项目资助

4株海洋红球菌产类胡萝卜素分析及其全基因组测序

摘要:以源于东太平洋海水的4株红球菌分离菌Rhodococcussp.EPR-134、Rhodococcus sp.EPR-147、Rhodococcus sp.EPR-157和Rhodococcus sp.EPR-279为研究对象,开展了菌株的色素提取和色素全波长扫描,并基于全基因组测序分析了4株细菌类胡萝卜素代谢通路中的相关基因.色素全波长扫描结果显示,菌株EPR-134不具备类胡萝卜素产生能力,而其它3株红球菌能够产生类胡萝卜素,且所产类胡萝卜素组分不同.基因组分析表明,4个细菌基因组中存在较为完整的促使类胡萝卜素形成的基因簇.对菌株参与番茄红素形成的3个关键基因crtE、crt B和crtI的氨基酸序列同源性两两比对分析表明,菌株EPR-134 3个基因氨基酸序列与其它3个菌株相应基因氨基酸序列同源性最低,这可能是导致该菌株不产类胡萝卜素的关键原因.该研究结果为产类胡萝卜素红球菌的遗传改造,以及为产类胡萝卜素工程菌的构建奠定了前期基础.

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