湖南某地区12株肠道病毒71型聚集性病例基因组的序列分析

       摘要: 目的 分析湖南省湘西某地区疾控中心 2013 年 6-9 月期间采集、分离的 12 株肠道病毒 71 型基因组具体序列,对其基因同源性进 行分析。方法 对 12 株肠道病毒 71 型感染的手足口病确诊患儿进行样本采集、分离、培养和核酸序列分析。结果 12 株 EV71 病毒中获得 5 个来源不同的 EV71 病毒;VP1 部分基因进行同源性分析具有高度同源性(高到 95.7%-100.0%)之间;基因全序列分析共存在 36 个碱基的差别。 结论 EV71 病毒分离株 VP1 基因进行全序列分析具有高度的同源性,可能存在共同的进化源,结合该地区上报和搜集病例的流行病学特征和人 群的聚集性特点。

作者:
李万峰 戴文辉 符清明
单位:
长沙医学院 湖南长沙 410219
出处:
《航空军医》
刊期:
2017年第45卷第7期
基金:
湖南省教育厅科研基金资助项目(NO:12C0527- 湖南地区肠道病毒 71 型分子流行病学研究)

湖南某地区12株肠道病毒71型聚集性病例基因组的序列分析

摘要:目的 分析湖南省湘西某地区疾控中心 2013 年 6-9 月期间采集、分离的 12 株肠道病毒 71 型基因组具体序列,对其基因同源性进 行分析。方法 对 12 株肠道病毒 71 型感染的手足口病确诊患儿进行样本采集、分离、培养和核酸序列分析。结果 12 株 EV71 病毒中获得 5 个来源不同的 EV71 病毒;VP1 部分基因进行同源性分析具有高度同源性(高到 95.7%-100.0%)之间;基因全序列分析共存在 36 个碱基的差别。 结论 EV71 病毒分离株 VP1 基因进行全序列分析具有高度的同源性,可能存在共同的进化源,结合该地区上报和搜集病例的流行病学特征和人 群的聚集性特点。

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