摘要: 利用转录组测序方法分析了不同毛色(白色和海狸色)獭兔皮肤组织中基因的表达差异,旨在找到影响獭兔毛色的候选基因.采用Illumina HiSeqTM2500测序平台对不同毛色獭兔耳组织中所有mRNA进行高通量测序,所得序列经质控、组装后比对到GO、COG、SWISS-PROT数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析和KEGG通路分析.结果表明:测序共获得Unigene 275 625个,差异表达基因12 408个,其中上调表达基因4 904个,下调表达基因7 504个.KEGG通路分析发现,这些差异基因显著地富集在13个代谢通路中,并在细胞色素代谢通路(metabolism of xenobiotics bycytochrome P450)中有8个差异表达的基因,其中CP2F1和CP2BB属于细胞色素P450家族成员,而GSTA4与黑素细胞分化有关,可能在獭兔毛色中发挥作用.
摘要：利用转录组测序方法分析了不同毛色(白色和海狸色)獭兔皮肤组织中基因的表达差异,旨在找到影响獭兔毛色的候选基因.采用Illumina HiSeqTM2500测序平台对不同毛色獭兔耳组织中所有mRNA进行高通量测序,所得序列经质控、组装后比对到GO、COG、SWISS-PROT数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析和KEGG通路分析.结果表明:测序共获得Unigene 275 625个,差异表达基因12 408个,其中上调表达基因4 904个,下调表达基因7 504个.KEGG通路分析发现,这些差异基因显著地富集在13个代谢通路中,并在细胞色素代谢通路(metabolism of xenobiotics bycytochrome P450)中有8个差异表达的基因,其中CP2F1和CP2BB属于细胞色素P450家族成员,而GSTA4与黑素细胞分化有关,可能在獭兔毛色中发挥作用.
说明：如本页面涉及到版权问题或作者不愿意公开，请联系本站管理员删除！
| [1] | 张逊 . 现代医学事业发展的新理念——充分利用互联网、大数据、人工智能 [J]. 中国肺癌杂志 ,2018,3 |
| [2] | 雄英 李明珍 张攀攀 张理意 杨跃 . 利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究 [J]. 中国肺癌杂志 ,2017,11 |
| [3] | 钱薇 胡云芳 朱余兵 樊宏伟 肖大伟 . 氯化钾缓释片人体药动学及相对生物利用度 [J]. 中国临床药学杂志 ,2008,1 |
| [4] | 汤文璐 张莉蓉 王永铭 杜文民 程能能 陈斌艳 . 社区老年糖尿病人群抗糖尿病药物的利用情况、依从性及影响因素 [J]. 中国临床药学杂志 ,2007,1 |
| [5] | 宋利军 田芳 张继宗 . 利用中国汉族成年人胸部正位CR片影像学特征判定年龄 [J]. 中国法医学杂志 ,2016,6 |
| [6] | 黄伟 鲁敏 张起 安华明 . 利用SRAP标记分析贵州砂梨资源遗传多样性 [J]. 西北植物学报 ,2016,2 |
| [7] | 黎珏希 罗欣 刘作华 陈思旭 孙钰锦 . 居民健康服务利用及其影响因素 [J]. 医师在线 ,2018,5 |
| [8] | 刘娟 . PBL教学法在口腔颌面外科门诊新护士带教中有效利用的探究 [J]. 维吾尔医药 ,2018,7 |
