摘要: 为研究牦牛硬脂酰辅酶 A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析.结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1080bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 kD,理论等电点(pI)为9.23,消光系数83895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构.
摘要:为研究牦牛硬脂酰辅酶 A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析.结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1080bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 kD,理论等电点(pI)为9.23,消光系数83895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构.
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[1] | 廖珂 柴志欣 张思源 钟金城 . miR-383在牦牛、犏牛睾丸组织中的差异表达及功能预测 [J]. 中国畜牧兽医 ,2016,2 |
[2] | 陈学生 杨秀梅 曹健 . 天祝牦牛Fas基因的克隆与生物信息学分析 [J]. 中国草食动物科学 ,2018,2 |
[3] | 郭宪 包鹏甲 胡显忠 丁学智 吴晓云 阎萍 裴杰 . 西藏亚东牦牛线粒体DNA分析及系统进化研究 [J]. 中国草食动物科学 ,2017,5 |
[4] | 裴杰 褚敏 包鹏甲 扎西卓玛 骆正杰 武甫德 梁春年 丁学智 王宏博 吴晓云 阎萍 郭宪 . 大通牦牛体尺与体重性状的多元线性回归与通径分析 [J]. 中国草食动物科学 ,2017,6 |
[5] | 涂世英 汪琦 柴志欣 钟金城 . 中甸牦牛 mtDNA D-Loop 区遗传多样性及系统进化分析 [J]. 中国草食动物科学 ,2016,3 |
[6] | 石红梅 李鹏霞 丁考仁青 杨勤 余群力 朱丹丹 马登录 才让闹日 . 甘南去势牦牛和公牦牛肉用品质和营养品质对比分析 [J]. 中国牛业科学 ,2018,1 |
[7] | 高月娥 王馨 刘彦培 和占星 杨凯 王喆 王安奎 . 云岭牛、婆罗门牛、中甸牦牛肉的矿物质含量及其营养价值评价 [J]. 中国牛业科学 ,2017,6 |
[8] | 王文飙 郭淑珍 才让闹日 李保明 赵光平 牟永娟 马登录 杨树猛 杨振 . 不同方案诱导牦牛发情效果研究 [J]. 中国牛业科学 ,2016,5 |