西藏亚东牦牛线粒体DNA分析及系统进化研究

       摘要: 应用基因测序技术对西藏亚东牦牛线粒体基因组进行测序,并对测序数据质控与修剪及基因组组装、精细注释、功能注释与分析.结果表明:亚东牦牛线粒体基因组大小约为15389 bp,包含13个PCGs、21个tRNAs、2个rRNAs及1个D-loop,其A+T碱基含量为60.86%,G+C碱基含量为39.14%;编码基因(PCGs、tRNAs&rRNAs)片段总长度为14495 bp,占基因组总长度的94.19%;同时,分析了亚东牦牛与其他11个物种间的进化关系,发现亚东牦牛与甘南牦牛归为一类,亲缘关系最近.西藏亚东牦牛线粒体DNA分析为研究牦牛群体遗传、起源与分子进化提供了技术参考.

作者:
郭宪 包鹏甲 胡显忠 丁学智 吴晓云 阎萍 裴杰
单位:
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州,730050 甘肃省科学院,兰州,730000
出处:
《中国草食动物科学》
刊期:
2017年第37卷第5期
基金:
现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项(CARS-37) 甘肃省科技支撑计划项目(1504NKCA052) 中国农业科学院创新工程(CAAS-ASTIP-2014-LIHPS-01)

西藏亚东牦牛线粒体DNA分析及系统进化研究

摘要:应用基因测序技术对西藏亚东牦牛线粒体基因组进行测序,并对测序数据质控与修剪及基因组组装、精细注释、功能注释与分析.结果表明:亚东牦牛线粒体基因组大小约为15389 bp,包含13个PCGs、21个tRNAs、2个rRNAs及1个D-loop,其A+T碱基含量为60.86%,G+C碱基含量为39.14%;编码基因(PCGs、tRNAs&rRNAs)片段总长度为14495 bp,占基因组总长度的94.19%;同时,分析了亚东牦牛与其他11个物种间的进化关系,发现亚东牦牛与甘南牦牛归为一类,亲缘关系最近.西藏亚东牦牛线粒体DNA分析为研究牦牛群体遗传、起源与分子进化提供了技术参考.

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