不同生物型BVDV感染宿主细胞后差异基因分析

       摘要: 为深入研究牛场中普遍存在的持续性感染,探讨不同生物型牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)转化的分子机制,本试验将致细胞病变型BVDV(CP型BVDV)和非致细胞病变型BVDV(NCP型BVDV)感染MDBK细胞,观察细胞变化,感染后12~72 h期间每间隔12h收集1次细胞,同时对24、48 h收集的细胞进行转录组学分析.结果显示,不同生物型BVDV感染宿主细胞24 h后,与感染NCP型BVDV的细胞相比,感染CP型BVDV的MDBK细胞中上调差异表达的基因2849个,下调差异表达的基因3347个,48 h后,上调差异表达的基因2933个,下调差异表达的基因2831个.对差异基因的GO功能分析结果表明,差异基因参与的分子功能主要有催化活性、结合活性、酶调节活性、分子转导活性和蛋白结合转录因子活性等;Pathway显著性富集分析结果显示,差异表达基因主要参与细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子等相关的信号通路.本试验结果可为进一步揭示病毒致病的分子机制、控制BVDV和研制其候选疫苗奠定基础.

作者:
程凯慧 朱彤 侯佩莉 王洪梅 苗自利 张亮 解晓莉 杨宏军 何洪彬
单位:
山东省农业科学院奶牛研究中心,济南,250131
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2017年第45卷第11期
基金:
十三五国家重点研发计划(2016YFD0500904) 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(BS2014SW008) 现代农业(奶牛)产业技术体系科学家岗位(CARS-36) 山东省农科院青年基金(2014QNM17) 山东省自然基金(ZR2016CP09) 山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2016B14、CXGC2016A10)

不同生物型BVDV感染宿主细胞后差异基因分析

摘要:为深入研究牛场中普遍存在的持续性感染,探讨不同生物型牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)转化的分子机制,本试验将致细胞病变型BVDV(CP型BVDV)和非致细胞病变型BVDV(NCP型BVDV)感染MDBK细胞,观察细胞变化,感染后12~72 h期间每间隔12h收集1次细胞,同时对24、48 h收集的细胞进行转录组学分析.结果显示,不同生物型BVDV感染宿主细胞24 h后,与感染NCP型BVDV的细胞相比,感染CP型BVDV的MDBK细胞中上调差异表达的基因2849个,下调差异表达的基因3347个,48 h后,上调差异表达的基因2933个,下调差异表达的基因2831个.对差异基因的GO功能分析结果表明,差异基因参与的分子功能主要有催化活性、结合活性、酶调节活性、分子转导活性和蛋白结合转录因子活性等;Pathway显著性富集分析结果显示,差异表达基因主要参与细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子等相关的信号通路.本试验结果可为进一步揭示病毒致病的分子机制、控制BVDV和研制其候选疫苗奠定基础.

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