摘要: 本研究参考黄牛甲状旁腺素(parathyroid hormone,PTH)基因序列设计引物,运用PCR扩增技术对水牛PTH基因进行克隆,并用生物信息学方法对序列进行分析.结果显示,成功克隆了水牛PTH基因完整编码区序列(CDS) 348 bp,可编码115个氨基酸.该基因编码区序列与黄牛、猪、马、山羊、绵羊和骆驼的同源性分别为99％、93％、91％、97％、96％和92％,表明PTH基因在不同物种间高度保守.系统进化树分析表明,水牛与黄牛PTH基因亲缘关系最近.此外,在水牛PTH基因CDS上共发现了3个碱基突变,其中两个属于同义突变,一个属于错义突变.氨基酸序列分析表明,该蛋白属于碱性、亲水、稳定型蛋白质,其分子式为C570 H941 N167O]64S8,分子质量为13.01 ku.二级结构分析显示,水牛PTH蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主,与三级结构预测结果相一致.亚细胞定位分析显示,水牛PTH蛋白分布在细胞质(26.1％)、线粒体(21.7％)、细胞外(包括细胞壁)(17.4％)、内质网(13.0％)、细胞核(8.7％)、高尔基体(4.3％)和其他部位(8.7％),推测PTH蛋白可能在运输、结合及细胞被膜等方面发挥信号转导和转录调控作用.
摘要：本研究参考黄牛甲状旁腺素(parathyroid hormone,PTH)基因序列设计引物,运用PCR扩增技术对水牛PTH基因进行克隆,并用生物信息学方法对序列进行分析.结果显示,成功克隆了水牛PTH基因完整编码区序列(CDS) 348 bp,可编码115个氨基酸.该基因编码区序列与黄牛、猪、马、山羊、绵羊和骆驼的同源性分别为99％、93％、91％、97％、96％和92％,表明PTH基因在不同物种间高度保守.系统进化树分析表明,水牛与黄牛PTH基因亲缘关系最近.此外,在水牛PTH基因CDS上共发现了3个碱基突变,其中两个属于同义突变,一个属于错义突变.氨基酸序列分析表明,该蛋白属于碱性、亲水、稳定型蛋白质,其分子式为C570 H941 N167O]64S8,分子质量为13.01 ku.二级结构分析显示,水牛PTH蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主,与三级结构预测结果相一致.亚细胞定位分析显示,水牛PTH蛋白分布在细胞质(26.1％)、线粒体(21.7％)、细胞外(包括细胞壁)(17.4％)、内质网(13.0％)、细胞核(8.7％)、高尔基体(4.3％)和其他部位(8.7％),推测PTH蛋白可能在运输、结合及细胞被膜等方面发挥信号转导和转录调控作用.
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