四川核桃良种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

       摘要: 为构建四川核桃良种指纹图谱,分析遗传多样性,增强品种间的区分能力,该研究利用SSR标记技术,对四川29个核桃良种进行遗传多样性和聚类分析.结果表明:(1)11对SSR引物共检测到121个基因型和80个等位基因,平均每个位点7.273个等位基因和11个基因型.(2)11个位点的平均有效等位基因数为3.644,平均观察杂合度为0.645,平均期望杂合度为0.718,平均香农信息指数为1.518,平均多态信息含量为0.680.(3)采用引物组合法利用引物wga001、wga032和zmz02构建了29个核桃品种的指纹图谱.(4)聚类分析结果表明,29个核桃品种按照品种类型优先聚类,四川本地核桃品种聚类关系与地理来源没有明显的相关性.研究认为,选用的11个SSR标记能够较好地运用于四川核桃品种的遗传多样性研究(PIC>0.5);29个四川核桃品种间亲缘关系较近,遗传基础相对较窄.

作者:
周于波 朱鹏 龚伟 王景燕 闫思宇 吴开志
单位:
四川农业大学林学院,林业生态工程四川省重点实验室,成都611130 四川省林木种苗站,成都,610081
出处:
《西北植物学报》
刊期:
2018年第38卷第7期
基金:
四川省林业厅项目(20140312) 四川省科技厅项目(2016NYZ0035,2017NFP0051,2017NFP0126)

四川核桃良种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

摘要: 为构建四川核桃良种指纹图谱,分析遗传多样性,增强品种间的区分能力,该研究利用SSR标记技术,对四川29个核桃良种进行遗传多样性和聚类分析.结果表明:(1)11对SSR引物共检测到121个基因型和80个等位基因,平均每个位点7.273个等位基因和11个基因型.(2)11个位点的平均有效等位基因数为3.644,平均观察杂合度为0.645,平均期望杂合度为0.718,平均香农信息指数为1.518,平均多态信息含量为0.680.(3)采用引物组合法利用引物wga001、wga032和zmz02构建了29个核桃品种的指纹图谱.(4)聚类分析结果表明,29个核桃品种按照品种类型优先聚类,四川本地核桃品种聚类关系与地理来源没有明显的相关性.研究认为,选用的11个SSR标记能够较好地运用于四川核桃品种的遗传多样性研究(PIC>0.5);29个四川核桃品种间亲缘关系较近,遗传基础相对较窄.

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