利用SNP芯片和BSA分析规模化定位小麦抗白粉病基因

       摘要: 规模化定位小麦品种携带的抗白粉病基因对于抗病性种质创新和新品种选育具有重要的意义.本研究采用Illumina Infinium iSelect 90k SNP芯片结合集群分离分析法(bulked segregate analysis,BSA)对36个河南省小麦新品系携带的抗白粉病基因进行了定位.SNP芯片检测表明,在24个小麦品系构建的抗、感池DNA间可检测到一个明显富集的SNP峰,表明其可能携带单一主效抗白粉病基因;在其他12个小麦品系构建的抗、感池DNA间可检测到多个SNP峰,推测其可能含多个抗白粉病基因.有26个小麦品系在2AL染色体上检测到的SNP数目最多,推测其携带位于2AL染色体上的Pm4b抗白粉病基因.开发出与2AL染色体上抗白粉病基因紧密连锁的分子标记Xwggc116,可用于这些小麦品系中抗白粉病基因的分子检测.研究结果表明,高通量SNP分析技术平台可以用来规模化定位小麦品种中的抗白粉病基因.明确了河南省抗白粉病小麦品系中携带Pm2、Pm4b、Pm21和新1BL/1RS易位等有限的抗白粉病基因,抗病基因资源非常狭窄,亟需引进新的多样化抗病基因资源,拓宽遗传基础,培育抗病小麦新品种.

作者:
吴秋红 陈永兴 李丹 王振忠 张艳 袁成国 王西成 赵虹 曹廷杰 刘志勇
单位:
中国科学院遗传与发育生物学研究所,北京,100101 中国农业大学,北京,100193 中国农村技术开发中心,北京,100045 河北省高邑县原种场,河北高邑,051330 河南省农业科学院小麦研究所,河南郑州,450002
出处:
《作物学报》
刊期:
2018年第44卷第1期
基金:
国家重点研发计划项目

利用SNP芯片和BSA分析规模化定位小麦抗白粉病基因

摘要:规模化定位小麦品种携带的抗白粉病基因对于抗病性种质创新和新品种选育具有重要的意义.本研究采用Illumina Infinium iSelect 90k SNP芯片结合集群分离分析法(bulked segregate analysis,BSA)对36个河南省小麦新品系携带的抗白粉病基因进行了定位.SNP芯片检测表明,在24个小麦品系构建的抗、感池DNA间可检测到一个明显富集的SNP峰,表明其可能携带单一主效抗白粉病基因;在其他12个小麦品系构建的抗、感池DNA间可检测到多个SNP峰,推测其可能含多个抗白粉病基因.有26个小麦品系在2AL染色体上检测到的SNP数目最多,推测其携带位于2AL染色体上的Pm4b抗白粉病基因.开发出与2AL染色体上抗白粉病基因紧密连锁的分子标记Xwggc116,可用于这些小麦品系中抗白粉病基因的分子检测.研究结果表明,高通量SNP分析技术平台可以用来规模化定位小麦品种中的抗白粉病基因.明确了河南省抗白粉病小麦品系中携带Pm2、Pm4b、Pm21和新1BL/1RS易位等有限的抗白粉病基因,抗病基因资源非常狭窄,亟需引进新的多样化抗病基因资源,拓宽遗传基础,培育抗病小麦新品种.

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