利用ISSR分子标记构建濒危植物水青树核心种质

       摘要: 基于全国26个居群的174份水青树Tetracentron sinense种质,利用14条ISSR引物,采用UPGMA聚类法进行多次逐步聚类,利用三种取样策略(随机取样策略、位点优先取样策略和偏离度取样策略)构建初始核心种质,并将各遗传多样性指标进行比较分析,从而确定构建水青树核心种质的最佳方法.利用14条ISSR引物扩增出180个条带,其观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)与Shannon信息指数(I)分别为1.6944、1.3912、0.2321和0.3509,说明水青树具有较低的遗传多样性.采用位点优先取样策略构建的核心种质各遗传多样性指数均大于随机取样策略和偏离度取样策略.利用位点优先取样策略构建了78份核心种质资源,保留了44.83%原种质样品,遗传多样性指数Na、Ne、H和I的保留率分别为98.69%、100.01%、99.27%和98.67%,比较完好地保留了原种质的遗传多样性和遗传变异.因此,位点优先取样策略是构建水青树核心种质的最佳取样策略.

作者:
段帆 张欢 李珊 田忠琼 甘小洪
单位:
西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室/西南山地特色植物种质适应与利用研究所,四川南充,637009
出处:
《亚热带植物科学》
刊期:
2018年第47卷第2期
基金:
四川省科技厅应用基础面上项目(2017JY0164) 西华师范大学英才基金(17YC325)

利用ISSR分子标记构建濒危植物水青树核心种质

摘要:基于全国26个居群的174份水青树Tetracentron sinense种质,利用14条ISSR引物,采用UPGMA聚类法进行多次逐步聚类,利用三种取样策略(随机取样策略、位点优先取样策略和偏离度取样策略)构建初始核心种质,并将各遗传多样性指标进行比较分析,从而确定构建水青树核心种质的最佳方法.利用14条ISSR引物扩增出180个条带,其观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)与Shannon信息指数(I)分别为1.6944、1.3912、0.2321和0.3509,说明水青树具有较低的遗传多样性.采用位点优先取样策略构建的核心种质各遗传多样性指数均大于随机取样策略和偏离度取样策略.利用位点优先取样策略构建了78份核心种质资源,保留了44.83%原种质样品,遗传多样性指数Na、Ne、H和I的保留率分别为98.69%、100.01%、99.27%和98.67%,比较完好地保留了原种质的遗传多样性和遗传变异.因此,位点优先取样策略是构建水青树核心种质的最佳取样策略.

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