传统中草药高通量测序技术 RNA-seq及lncRNA挖掘的应用策略

       摘要: 中草药作为中国传统中医特有药物已有上千年的历史,然而对中草药资源关键生物学过程中的功能基因挖掘却刚刚起步。 lncRNA功能研究越来越引起人们的重视,结合RNA-seq技术研究中草药转录组中lncRNA功能,有望揭示中草药的生长、发育、代谢等生物学过程中的分子机制。综述了RNA-seq高通量测序及在中草药转录组测序中的应用策略,简述了lncRNA主要生物学功能及分析方法,并对RNA-seq技术和lncRNA生物信息学分析方法中存在的问题进行了简要讨论。

作者:
白晶 李力恒 孙尧 扈韵绮 付博
单位:
黑龙江中医药大学,黑龙江 哈尔滨,150040 黑龙江省农业科学院博士后科研工作站,东北林业大学博士后科研流动站,黑龙江 哈尔滨 150086; 黑龙江省农业科学院畜牧研究所,黑龙江 哈尔滨 150086
出处:
《中医药信息》
刊期:
2014年第31卷第2期
基金:
国家自然科学基金 黑龙江省自然科学基金 黑龙江省中医药科研项目 黑龙江省博士后基金

传统中草药高通量测序技术 RNA-seq及lncRNA挖掘的应用策略

摘要: 中草药作为中国传统中医特有药物已有上千年的历史,然而对中草药资源关键生物学过程中的功能基因挖掘却刚刚起步。 lncRNA功能研究越来越引起人们的重视,结合RNA-seq技术研究中草药转录组中lncRNA功能,有望揭示中草药的生长、发育、代谢等生物学过程中的分子机制。综述了RNA-seq高通量测序及在中草药转录组测序中的应用策略,简述了lncRNA主要生物学功能及分析方法,并对RNA-seq技术和lncRNA生物信息学分析方法中存在的问题进行了简要讨论。

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