水稻抗咪唑啉酮类除草剂基因ALS功能标记的开发与应用

       摘要: 选育和利用抗除草剂水稻品种具有重要的生产实践意义.通过筛选水稻资源,发现了抗除草剂材料金粳818,其ALS基因编码区第1880位碱基存在一个由G到A的碱基变异,导致丝氨酸突变为天冬酰胺,从而具有除草剂抗性.本研究基于该位点的碱基变异,设计了11条等位基因特异PCR (allelic-specific PCR,AS-PCR)引物,经过优化筛选,获得两个引物组合F1N (S1/S9)和F1M (S1/S10),将该标记命名为AS-ALS.利用F2群体及其亲本和杂交种,结合AS-ALS标记检测和除草剂抗性分析,结果表明感除草剂ALS-G等位基因型只能被F1N引物对有效扩增,抗除草剂ALS-A等位基因型只能被F1M引物对有效扩增,而杂合基因型能同时被两对引物F1N和F1M扩增,ALS-A纯合或杂合等位基因型都表现抗除草剂,ALS-G纯合基因型表现感除草剂.因此本研究开发的标记能有效区分除草剂抗性基因的3种基因型,基因型与表型完全对应.该标记用于回交育种,可以选择ALS-A杂合基因型单株,剔除ALS-G纯合等位基因型,在自交的F2保留ALS-A纯合基因型单株,连续自交,能快速获得除草剂抗性稳定的水稻材料.该除草剂抗性基因的功能标记还可用于咪唑啉酮类除草剂抗性资源筛选.

作者:
王芳权 杨杰 范方军 李文奇 王军 许扬 朱金燕 费云燕 仲维功
单位:
江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家水稻改良中心南京分中心/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏南京210014;扬州大学/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心,江苏扬州225009 江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家水稻改良中心南京分中心/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏南京,210014
出处:
《作物学报》
刊期:
2018年第44卷第3期
基金:
国家重点研发计划项目(2017YFD0100400-3) 江苏省现代农业重点研发项目(BE2015355) 江苏省农业科学院探索性项目(ZX(17)2014) 江苏省自然科学基金面上项目(BK20171326) 国家公益性行业科研专项项目(201303102)资助

水稻抗咪唑啉酮类除草剂基因ALS功能标记的开发与应用

摘要:选育和利用抗除草剂水稻品种具有重要的生产实践意义.通过筛选水稻资源,发现了抗除草剂材料金粳818,其ALS基因编码区第1880位碱基存在一个由G到A的碱基变异,导致丝氨酸突变为天冬酰胺,从而具有除草剂抗性.本研究基于该位点的碱基变异,设计了11条等位基因特异PCR (allelic-specific PCR,AS-PCR)引物,经过优化筛选,获得两个引物组合F1N (S1/S9)和F1M (S1/S10),将该标记命名为AS-ALS.利用F2群体及其亲本和杂交种,结合AS-ALS标记检测和除草剂抗性分析,结果表明感除草剂ALS-G等位基因型只能被F1N引物对有效扩增,抗除草剂ALS-A等位基因型只能被F1M引物对有效扩增,而杂合基因型能同时被两对引物F1N和F1M扩增,ALS-A纯合或杂合等位基因型都表现抗除草剂,ALS-G纯合基因型表现感除草剂.因此本研究开发的标记能有效区分除草剂抗性基因的3种基因型,基因型与表型完全对应.该标记用于回交育种,可以选择ALS-A杂合基因型单株,剔除ALS-G纯合等位基因型,在自交的F2保留ALS-A纯合基因型单株,连续自交,能快速获得除草剂抗性稳定的水稻材料.该除草剂抗性基因的功能标记还可用于咪唑啉酮类除草剂抗性资源筛选.

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