常染色体遗传标记直系亲缘关系指数的统一算法

       摘要: 目的 通过理论推导的方法,对应用常染色体遗传标记进行的直系亲缘关系鉴定中亲缘关系指数(kinship index,KI),尤其是亲子鉴定中父权指数(Paternity index,PI)的统一算法进行探索.方法 根据亲缘关系指数的似然率(Likelihood Ratio,LR)属性,应用概率论与遗传学方法,对不同情况下亲缘关系指数的统一计算公式进行推导与总结,然后通过特殊代入的方法,推导二联体和三联体父权指数的统一计算公式.结果 发现相同鉴定条件下,不论参与鉴定的个体的基因型组合如何变化,他们之间的亲缘关系指数均可代入统一的公式进行计算.在无亲代参考的直系亲缘关系鉴定中,KID=1/2G+1(di/Pi+dj/Pj)+2G-1-1/2G-1其中二联体父权指数PID=1/4(di/Pi+dj/Pj);而在有亲代参考的直系亲缘关系鉴定中,KIT=d'jdi+d'idj/2G(d'iPi+d'iPi)+2G-1-1/2G-1,其中三联体父权指数PIT=d'idj+did'j/2(d'jPi+d'iPj)(公式中各变量定义见正文).结论 上述公式在二联体、三联体亲子鉴定及两个体间祖孙关系鉴定的指数计算中,所得结果与当前公认的计算结果相同,且在计算中,不需要考虑状态一致性(identity by state,IBS)因素,为编程批量计算提供了更加简便的思路.

作者:
马冠车 李淑瑾 丛斌
单位:
河北医科大学法医学院河北省法医学重点实验室,河北石家庄,050017
出处:
《中国法医学杂志》
刊期:
2018年第33卷第3期

常染色体遗传标记直系亲缘关系指数的统一算法

摘要: 目的 通过理论推导的方法,对应用常染色体遗传标记进行的直系亲缘关系鉴定中亲缘关系指数(kinship index,KI),尤其是亲子鉴定中父权指数(Paternity index,PI)的统一算法进行探索.方法 根据亲缘关系指数的似然率(Likelihood Ratio,LR)属性,应用概率论与遗传学方法,对不同情况下亲缘关系指数的统一计算公式进行推导与总结,然后通过特殊代入的方法,推导二联体和三联体父权指数的统一计算公式.结果 发现相同鉴定条件下,不论参与鉴定的个体的基因型组合如何变化,他们之间的亲缘关系指数均可代入统一的公式进行计算.在无亲代参考的直系亲缘关系鉴定中,KID=1/2G+1(di/Pi+dj/Pj)+2G-1-1/2G-1其中二联体父权指数PID=1/4(di/Pi+dj/Pj);而在有亲代参考的直系亲缘关系鉴定中,KIT=d'jdi+d'idj/2G(d'iPi+d'iPi)+2G-1-1/2G-1,其中三联体父权指数PIT=d'idj+did'j/2(d'jPi+d'iPj)(公式中各变量定义见正文).结论 上述公式在二联体、三联体亲子鉴定及两个体间祖孙关系鉴定的指数计算中,所得结果与当前公认的计算结果相同,且在计算中,不需要考虑状态一致性(identity by state,IBS)因素,为编程批量计算提供了更加简便的思路.

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