三疣梭子蟹核受体基因HR38的克隆及其在蜕皮中的表达分析

       摘要: 采用RACE技术,克隆出三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)核受体基因HR38的cDNA全长,命名为PTHR38。该基因cDNA序列全长为2950 bp,5′和3′非编码区(UTR)长分别为101 bp和551 bp,开放阅读框(ORF)长2298 bp。推测编码765个氨基酸,预测分子量为84.2 kD,理论等电点为6.3。生物学分析预测,PTHR38基因编码的蛋白属于不稳定蛋白,不具有跨膜结构域。同源性分析表明,PTHR38溞基因编码的氨基酸序列与大型(Daphnia magna)的同源性最高。实时荧光定量分析表明, PTHR38基因在蜕皮周期的各个组织中均有差异表达,在眼柄中表达差异最大。去除单侧眼柄后, PTHR38的表达量在整体上呈现不同程度的上升趋势。

作者:
张龙涛 吕建建 高保全 刘萍 付萍
单位:
中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛 266071; 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛,266071
出处:
《中国水产科学》
刊期:
2016年第23卷第2期
基金:
国家自然科学基金资助项目(41306177,41576147)

三疣梭子蟹核受体基因HR38的克隆及其在蜕皮中的表达分析

摘要:采用RACE技术,克隆出三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)核受体基因HR38的cDNA全长,命名为PTHR38。该基因cDNA序列全长为2950 bp,5′和3′非编码区(UTR)长分别为101 bp和551 bp,开放阅读框(ORF)长2298 bp。推测编码765个氨基酸,预测分子量为84.2 kD,理论等电点为6.3。生物学分析预测,PTHR38基因编码的蛋白属于不稳定蛋白,不具有跨膜结构域。同源性分析表明,PTHR38溞基因编码的氨基酸序列与大型(Daphnia magna)的同源性最高。实时荧光定量分析表明, PTHR38基因在蜕皮周期的各个组织中均有差异表达,在眼柄中表达差异最大。去除单侧眼柄后, PTHR38的表达量在整体上呈现不同程度的上升趋势。

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