齐口裂腹鱼SNP标记与生长性状的关联分析

       摘要: 齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)是中国特有的冷水性经济鱼类, 具有较高的营养和经济价值.为了研究齐口裂腹鱼生长性状关联的分子标记, 本研究以114尾同批次繁殖、相同养殖条件的齐口裂腹鱼为研究材料, 运用26个齐口裂腹鱼SNPs位点进行生长性状(体重、体高、全长、体长)关联分析.对齐口裂腹鱼生长性状的主成分分析表明, 体重占解释方差的93.42%, 且特征根大于1, 累积方差大于85%, 是齐口裂腹鱼生长性状的第一主成分.SNPs位点与生长性状相关分析结果显示:ug17711-0-2201与全长呈显著相关(P<0.05),ug24013-0-3669对全长、体长有显著影响(P<0.05),ug25050-0-1678对体重、体高、全长和体长都有显著影响(P<0.05),ug22712-0-2452对体重、体高、全长和体长都有极显著影响(P<0.01).对与生长性状显著相关的4个SNPs位点进行多态性检测, 平均观测杂合度和期望杂合度分别为 0.2369 和 0.2110,平均多态信息含量为 0.18,其中 ug25050-0-1678 具有中度多态性(0.25≤PIC<0.5).综上所述,ug25050-0-1678和ug22712-0-2452与生长性状具有显著相关性,可作为候选位点用于齐口裂腹鱼的分子标记辅助育种.本研究旨为齐口裂腹鱼的遗传改良和选择育种提供基础资料.

作者:
杨月静 向梦斌 叶祥益 张争世 罗辉 叶华
单位:
西南大学 鱼类繁育与健康养殖研究中心,重庆,402460
出处:
《中国水产科学》
刊期:
2018年第25卷第2期
基金:
国家自然科学基金资助项目(31402302) 中央高校基本科研业务费资助项目(XDJK2017B008) 西南大学荣昌校区青年基金资助项目(20700938)

齐口裂腹鱼SNP标记与生长性状的关联分析

摘要: 齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)是中国特有的冷水性经济鱼类, 具有较高的营养和经济价值.为了研究齐口裂腹鱼生长性状关联的分子标记, 本研究以114尾同批次繁殖、相同养殖条件的齐口裂腹鱼为研究材料, 运用26个齐口裂腹鱼SNPs位点进行生长性状(体重、体高、全长、体长)关联分析.对齐口裂腹鱼生长性状的主成分分析表明, 体重占解释方差的93.42%, 且特征根大于1, 累积方差大于85%, 是齐口裂腹鱼生长性状的第一主成分.SNPs位点与生长性状相关分析结果显示:ug17711-0-2201与全长呈显著相关(P<0.05),ug24013-0-3669对全长、体长有显著影响(P<0.05),ug25050-0-1678对体重、体高、全长和体长都有显著影响(P<0.05),ug22712-0-2452对体重、体高、全长和体长都有极显著影响(P<0.01).对与生长性状显著相关的4个SNPs位点进行多态性检测, 平均观测杂合度和期望杂合度分别为 0.2369 和 0.2110,平均多态信息含量为 0.18,其中 ug25050-0-1678 具有中度多态性(0.25≤PIC<0.5).综上所述,ug25050-0-1678和ug22712-0-2452与生长性状具有显著相关性,可作为候选位点用于齐口裂腹鱼的分子标记辅助育种.本研究旨为齐口裂腹鱼的遗传改良和选择育种提供基础资料.

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