猪DNM2基因克隆、序列分析与组织表达谱研究

       摘要: 本研究旨在对猪发动蛋白2(dynamin-2,DNM2)基因进行克隆和生物信息学分析,并探讨DNM2基因在猪不同组织中的表达情况.利用RT-PCR结合RACE方法克隆猪DNM2基因cDNA部分序列,与猪表达序列标签进行拼接,获得猪DNM2基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR检测DNM2基因在猪不同组织中的表达情况.结果表明,猪DNM2基因的开放阅读框(open reading fram,ORF)为2 616 bp,共编码871个氨基酸.DNM2相对分子质量为98 071.30,等电点(pI)为7.04;无信号肽和跨膜结构域,即该蛋白不属于分泌蛋白;DNM2蛋白的二级结构预测发现,构成α-螺旋、β转角、无规则卷曲、延展链的氨基酸数量分别为361、53、335和122个.多重分析结果显示,猪DNM2基因与牛、人、小鼠、大鼠的序列同源性分别为92.6%、91.8%、88.6%和89.3%;进化树分析表明,DNM2基因在物种间具有较高的保守性,不同物种间DNM2基因序列的差异符合物种间的进化性.实时荧光定量PCR结果显示,DNM2基因在脾脏中表达量较高,在乳腺、腿肌、输卵管、卵巢和子宫中表达量均较低.本研究结果为今后深入研究DNM2基因的生物学功能奠定了基础.

作者:
裴悦 周晓龙 杨松柏 赵阿勇
单位:
浙江农林大学动物科技学院,临安,311300
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2017年第44卷第9期
基金:
国家自然科学基金(31501921) 浙江省自然科学基金(LQ15C170001) 浙江省农业(畜禽)新品种选育重大科技专项(2016C02054-3)

猪DNM2基因克隆、序列分析与组织表达谱研究

摘要:本研究旨在对猪发动蛋白2(dynamin-2,DNM2)基因进行克隆和生物信息学分析,并探讨DNM2基因在猪不同组织中的表达情况.利用RT-PCR结合RACE方法克隆猪DNM2基因cDNA部分序列,与猪表达序列标签进行拼接,获得猪DNM2基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR检测DNM2基因在猪不同组织中的表达情况.结果表明,猪DNM2基因的开放阅读框(open reading fram,ORF)为2 616 bp,共编码871个氨基酸.DNM2相对分子质量为98 071.30,等电点(pI)为7.04;无信号肽和跨膜结构域,即该蛋白不属于分泌蛋白;DNM2蛋白的二级结构预测发现,构成α-螺旋、β转角、无规则卷曲、延展链的氨基酸数量分别为361、53、335和122个.多重分析结果显示,猪DNM2基因与牛、人、小鼠、大鼠的序列同源性分别为92.6%、91.8%、88.6%和89.3%;进化树分析表明,DNM2基因在物种间具有较高的保守性,不同物种间DNM2基因序列的差异符合物种间的进化性.实时荧光定量PCR结果显示,DNM2基因在脾脏中表达量较高,在乳腺、腿肌、输卵管、卵巢和子宫中表达量均较低.本研究结果为今后深入研究DNM2基因的生物学功能奠定了基础.

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