牛GUCY1A3和SFXN1基因的克隆及生物信息学分析

       摘要: 试验以人GUCY1A3和SFXN1基因序列为探针,BLAST获得同源性较高的牛的表达序列标签(ESTs)序列及部分mRNA序列.通过RT-PCR方法从牛肌肉及脑组织克隆cDNA序列与牛表达序列标签进行拼接,获得牛GUCY1A3和SFXN1基因,并对其进行了生物学特性分析.序列分析表明,牛GUCY1A3基因编码区长2 076 bp,编码691个氨基酸;牛SFXN1基因编码区长969 bp,编码322个氨基酸.氨基酸序列分析表明,GUCY1A3蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在细胞质中,不属于分泌蛋白,二级结构预测以a螺旋为主,保守结构域含1个CYCc功能结构域;SFXN1蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在内质网和浆膜上,属于跨膜蛋白,二级结构以a螺旋为主,保守结构域含1段低复杂度序列和3段跨膜螺旋区.试验结果为进一步研究牛GUCY1A3和SFXN1基因的表达调控机制与功能奠定了基础.

作者:
靳聪飞 梁婷玉 刘新峰 郭宏
单位:
天津农学院动物科学与动物医学学院,天津,300384
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2017年第44卷第2期
基金:
高产转基因肉牛新品种培育(2014ZX08007-002)

牛GUCY1A3和SFXN1基因的克隆及生物信息学分析

摘要:试验以人GUCY1A3和SFXN1基因序列为探针,BLAST获得同源性较高的牛的表达序列标签(ESTs)序列及部分mRNA序列.通过RT-PCR方法从牛肌肉及脑组织克隆cDNA序列与牛表达序列标签进行拼接,获得牛GUCY1A3和SFXN1基因,并对其进行了生物学特性分析.序列分析表明,牛GUCY1A3基因编码区长2 076 bp,编码691个氨基酸;牛SFXN1基因编码区长969 bp,编码322个氨基酸.氨基酸序列分析表明,GUCY1A3蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在细胞质中,不属于分泌蛋白,二级结构预测以a螺旋为主,保守结构域含1个CYCc功能结构域;SFXN1蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在内质网和浆膜上,属于跨膜蛋白,二级结构以a螺旋为主,保守结构域含1段低复杂度序列和3段跨膜螺旋区.试验结果为进一步研究牛GUCY1A3和SFXN1基因的表达调控机制与功能奠定了基础.

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