猪BLM基因N端 、C端的克隆及其在不同组织与疾病中的表达分析

       摘要: 为探究猪BLM解旋酶N端、C端的结构功能及其在不同组织和疾病中的相对表达量,本研究采用RT-PCR技术扩增从江香猪BLM基因N端和C端,利用生物信息学软件对克隆所获序列进行分析,同时采用实时荧光定量PCR技术分析BLM基因在猪不同组织及病样中的表达差异.结果显示,试验成功克隆了从江香猪BLM基因N端1025 bp和C端1300 bp序列,与GenBank中猪BLM基因序列(登录号:NM_001123084.1)同源性为100%;生物信息学软件预测显示,猪B L M基因序列长度为4316 bp,包含4280 bp的开放阅读框,编码一个由1426个氨基酸组成的多肽链;氨基酸序列比对发现,猪B L M基因氨基酸序列与牛的同源性最高(85%);结构域预测表明,猪BLM基因有DEXDc、HELICc、RQC和HRDC 4个结构域;系统进化树分析表明,猪BLM基因与牛亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果显示,以心脏为对照,BLM基因在从江香猪各组织中均有表达,其中在睾丸中的相对表达量最高,其次为肺脏、肝脏、脾脏、心脏、肾脏、小肠和大肠,在睾丸和肺脏中的表达量均极显著高于其他组织(P<0.01);BLM基因在患繁殖与呼吸道综合征猪肺脏、患白血病鸡肝脏和患鸭瘟鸭肝脏中的表达水平均极显著或显著高于正常组织(P<0.01;P<0.05),提示BLM基因的变化可能也会导致动物疾病的发生.本试验结果可为后续畜禽BLM解旋酶原核表达载体的构建及其在重大疾病的发生和预防等研究提供理论依据.

作者:
王赛楠 许厚强 赵佳福
单位:
贵州大学 ,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 ,贵阳 550025;贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室 ,贵阳550025;贵州大学生命科学学院 ,贵阳550025
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2018年第45卷第8期
基金:
国家自然科学基金(700703131123) 教育部中国与美大、欧洲地区教育科研合作项目(教财司函[2017]860号)

猪BLM基因N端 、C端的克隆及其在不同组织与疾病中的表达分析

摘要:为探究猪BLM解旋酶N端、C端的结构功能及其在不同组织和疾病中的相对表达量,本研究采用RT-PCR技术扩增从江香猪BLM基因N端和C端,利用生物信息学软件对克隆所获序列进行分析,同时采用实时荧光定量PCR技术分析BLM基因在猪不同组织及病样中的表达差异.结果显示,试验成功克隆了从江香猪BLM基因N端1025 bp和C端1300 bp序列,与GenBank中猪BLM基因序列(登录号:NM_001123084.1)同源性为100%;生物信息学软件预测显示,猪B L M基因序列长度为4316 bp,包含4280 bp的开放阅读框,编码一个由1426个氨基酸组成的多肽链;氨基酸序列比对发现,猪B L M基因氨基酸序列与牛的同源性最高(85%);结构域预测表明,猪BLM基因有DEXDc、HELICc、RQC和HRDC 4个结构域;系统进化树分析表明,猪BLM基因与牛亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果显示,以心脏为对照,BLM基因在从江香猪各组织中均有表达,其中在睾丸中的相对表达量最高,其次为肺脏、肝脏、脾脏、心脏、肾脏、小肠和大肠,在睾丸和肺脏中的表达量均极显著高于其他组织(P<0.01);BLM基因在患繁殖与呼吸道综合征猪肺脏、患白血病鸡肝脏和患鸭瘟鸭肝脏中的表达水平均极显著或显著高于正常组织(P<0.01;P<0.05),提示BLM基因的变化可能也会导致动物疾病的发生.本试验结果可为后续畜禽BLM解旋酶原核表达载体的构建及其在重大疾病的发生和预防等研究提供理论依据.

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