摘要: 为探讨小反刍兽疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV)贵州流行株N基因分子特征和分群,试验设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对小反刍兽疫(peste des petits ruminants,PPR)临床样本进行N基因扩增,克隆至pMD19-T载体,对阳性重组质粒进行测序,应用DANStar软件对测序序列和参考序列进行核苷酸同源性、氨基酸同源性、变异位点及系统进化树分析.结果显示:PPRV贵州流行株N基因扩增长度为1578 bp,其相互间核苷酸、氨基酸同源性分别为99.6％ ～100.0％ 及99.2％ ～100.0％,与国内参考株N基因的核苷酸序列(97.7％ ～99.9％)及氨基酸序列(98.3％ ～100.0％)同源性较国外参考株(88.5％ ～97.7％ 和92.2％ ～98.5％)高;PPRV贵州流行株N基因编码的氨基酸同疫苗株Nigeria 75-1相比存在26个位点突变,但没有氨基酸的缺失或增加;基于N基因系统进化分析显示,PPRV贵州流行株同国内参考株处于同一个进化分支,但与国外参考株处于不同进化分支;其属于病毒进化的Ⅳ基因群,与国内参考株处于同一系统分群,但与疫苗株Nigeria 75-1(Ⅰ基因群)处于不同基因群.
摘要： 为探讨小反刍兽疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV)贵州流行株N基因分子特征和分群,试验设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对小反刍兽疫(peste des petits ruminants,PPR)临床样本进行N基因扩增,克隆至pMD19-T载体,对阳性重组质粒进行测序,应用DANStar软件对测序序列和参考序列进行核苷酸同源性、氨基酸同源性、变异位点及系统进化树分析.结果显示:PPRV贵州流行株N基因扩增长度为1578 bp,其相互间核苷酸、氨基酸同源性分别为99.6％ ～100.0％ 及99.2％ ～100.0％,与国内参考株N基因的核苷酸序列(97.7％ ～99.9％)及氨基酸序列(98.3％ ～100.0％)同源性较国外参考株(88.5％ ～97.7％ 和92.2％ ～98.5％)高;PPRV贵州流行株N基因编码的氨基酸同疫苗株Nigeria 75-1相比存在26个位点突变,但没有氨基酸的缺失或增加;基于N基因系统进化分析显示,PPRV贵州流行株同国内参考株处于同一个进化分支,但与国外参考株处于不同进化分支;其属于病毒进化的Ⅳ基因群,与国内参考株处于同一系统分群,但与疫苗株Nigeria 75-1(Ⅰ基因群)处于不同基因群.
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