摘要: 为了揭示香猪繁殖调控的分子机制,本试验结合生物信息学分析方法对 StAR和CYP11A1基因在香猪卵巢组织中的差异表达进行分析.运用实时荧光定量PCR方法检测高、低产群体6月龄香猪卵巢组织中 StA R和CYP11A1基因的表达量变化;从香猪基因组中克隆两个基因的启动子区域,分析两个基因表达差异的分子机制.高通量转录组测序和实时荧光定量PCR检测结果均显示,高产香猪两个基因的表达量较高,启动子区序列长分别为1144与970 bp.StAR基因启动子区结合转录因子 ER、COUP、Sp1等34种72个,转录起始位点上游68~698 bp存在8个变异位点,但不影响转录因子的结合;与 CYP11A1基因启动子区相结合的转录因子为Sp1、PU.1、C/EBPdel等30种75个,转录起始位点上游12~593 bp存在5个变异位点,其中69 bp处检测到C-T 变异,高产香猪的T等位基因检出频率为17%,低产香猪为33%;对预测结果整合分析,T等位基因丢失了转录因子Sp1的结合位点.高、低产香猪之间 StAR和CYP11A1基因的表达存在差异,CYP11A1基因启动子区69 bp处的变异可能是基因表达量差异的原因之一.
摘要:为了揭示香猪繁殖调控的分子机制,本试验结合生物信息学分析方法对 StAR和CYP11A1基因在香猪卵巢组织中的差异表达进行分析.运用实时荧光定量PCR方法检测高、低产群体6月龄香猪卵巢组织中 StA R和CYP11A1基因的表达量变化;从香猪基因组中克隆两个基因的启动子区域,分析两个基因表达差异的分子机制.高通量转录组测序和实时荧光定量PCR检测结果均显示,高产香猪两个基因的表达量较高,启动子区序列长分别为1144与970 bp.StAR基因启动子区结合转录因子 ER、COUP、Sp1等34种72个,转录起始位点上游68~698 bp存在8个变异位点,但不影响转录因子的结合;与 CYP11A1基因启动子区相结合的转录因子为Sp1、PU.1、C/EBPdel等30种75个,转录起始位点上游12~593 bp存在5个变异位点,其中69 bp处检测到C-T 变异,高产香猪的T等位基因检出频率为17%,低产香猪为33%;对预测结果整合分析,T等位基因丢失了转录因子Sp1的结合位点.高、低产香猪之间 StAR和CYP11A1基因的表达存在差异,CYP11A1基因启动子区69 bp处的变异可能是基因表达量差异的原因之一.
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