三穗麻鸭Cofilin2基因序列分析及其组织表达研究

       摘要: 为探究三穗麻鸭丝切蛋白2 (Cofilin2)基因特征及其在鸭组织中的表达规律,试验根据GenBank中鸡C0-filin2基因序列设计特异性引物,利用RT-PCR方法扩增获得目的基因,利用生物信息学软件分析三穗麻鸭Cofilin2基因特征,实时荧光定量PCR方法检测Cofilin2基因在三穗麻鸭不同组织中的表达情况.结果显示,三穗麻鸭Cofilin2基因编码区大小为498 bp,可编码166个氨基酸;三穗麻鸭Cofilin2基因序列与鸡、猕猴、牛、小鼠、安大略鲑、人和猪相应序列的同源性分别为94.4%、91.6%、91.6%、87.6%、77.7%、70.5%和69.5%;系统进化树显示,Cofilin2基因在不同物种进化过程中高度保守;Cofilin2基因编码蛋白的二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构呈弯曲螺旋结构;实时荧光定量PCR检测显示,三穗麻鸭Cofilin2基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脑、胸腺、十二指肠、腿肌和法氏囊等组织器官中均有不同程度表达,其中心脏中表达量最高,法氏囊中表达量最低.本试验结果为三穗麻鸭抗病分子机理研究奠定了基础.

作者:
文明
单位:
贵州大学动物科学学院,贵阳,550025 贵州大学动物科学学院,贵阳550025;贵州大学动物疫病研究所,贵阳550025;贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵阳550025
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2018年第45卷第4期
基金:
国家自然科学基金项目(31260607、31560703) 贵州省优秀青年科学人才培养计划项目(黔科合人字[2013]25号) 贵州省百层次创新型人才项目(黔科合人才[2016]4009号) 贵州省科技创新人才团队建设项目(黔科合人才团队[2015]4016号) 贵州大学研究生创新基金项目(研农2017001)

三穗麻鸭Cofilin2基因序列分析及其组织表达研究

摘要:为探究三穗麻鸭丝切蛋白2 (Cofilin2)基因特征及其在鸭组织中的表达规律,试验根据GenBank中鸡C0-filin2基因序列设计特异性引物,利用RT-PCR方法扩增获得目的基因,利用生物信息学软件分析三穗麻鸭Cofilin2基因特征,实时荧光定量PCR方法检测Cofilin2基因在三穗麻鸭不同组织中的表达情况.结果显示,三穗麻鸭Cofilin2基因编码区大小为498 bp,可编码166个氨基酸;三穗麻鸭Cofilin2基因序列与鸡、猕猴、牛、小鼠、安大略鲑、人和猪相应序列的同源性分别为94.4%、91.6%、91.6%、87.6%、77.7%、70.5%和69.5%;系统进化树显示,Cofilin2基因在不同物种进化过程中高度保守;Cofilin2基因编码蛋白的二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构呈弯曲螺旋结构;实时荧光定量PCR检测显示,三穗麻鸭Cofilin2基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脑、胸腺、十二指肠、腿肌和法氏囊等组织器官中均有不同程度表达,其中心脏中表达量最高,法氏囊中表达量最低.本试验结果为三穗麻鸭抗病分子机理研究奠定了基础.

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