一株鸭源H1N6亚型禽流感病毒的分离鉴定及HA和NA基因序列分析

       摘要: 为了解禽流感病毒(AIV)在广西中越边境地区的流行情况,本研究在该地区活禽市场开展禽流感病原监测.监测过程中分离鉴定出1株H1N6亚型禽流感病毒,命名为A/Duck/Guangxi/F01/2016 (H1N6),对其HA和NA基因进行序列测定,并与GenBank中下载的相关参考序列进行比对和遗传进化分析.结果显示,分离株HA基因与A/sparrow/Guangxi/GXs-1/2012(H1 N2)的核苷酸同源性最高(96.9%),NA基因与A/Pavo cristatus/Jiangxi/JA1/2016(H5 N6)的核苷酸同源性最高(98.2%).HA基因裂解位点氨基酸序列为PSIQSR↓ GLF,符合低致病性禽流感病毒分子特征;与部分N6亚型禽流感病毒一样,分离株NA基因有11个氨基酸缺失.此外,本研究还对分离毒株的受体亲和性进行了测定,结果显示该病毒优先结合唾液酸α-2,3 Gal受体.本研究结果表明A/Duck/Guangxi/F01/2016(H1N6)是一株重组低致病性禽流感病毒.

作者:
熊文婕 谢芝勋 李孟 曹国敏 覃海 严小东
单位:
防城港市动物疫病预防控制中心,防城港,538001 广西兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室,南宁,530001 防城港市畜牧站,防城港,538001
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2018年第45卷第2期
基金:
广西兽医生物技术重点实验开放基金(16-380-45-B-1) 广西科技基地和人才专项项目(桂科AD16380009) 防城港科技基地和人才专项(防科AC17005006)

一株鸭源H1N6亚型禽流感病毒的分离鉴定及HA和NA基因序列分析

摘要:为了解禽流感病毒(AIV)在广西中越边境地区的流行情况,本研究在该地区活禽市场开展禽流感病原监测.监测过程中分离鉴定出1株H1N6亚型禽流感病毒,命名为A/Duck/Guangxi/F01/2016 (H1N6),对其HA和NA基因进行序列测定,并与GenBank中下载的相关参考序列进行比对和遗传进化分析.结果显示,分离株HA基因与A/sparrow/Guangxi/GXs-1/2012(H1 N2)的核苷酸同源性最高(96.9%),NA基因与A/Pavo cristatus/Jiangxi/JA1/2016(H5 N6)的核苷酸同源性最高(98.2%).HA基因裂解位点氨基酸序列为PSIQSR↓ GLF,符合低致病性禽流感病毒分子特征;与部分N6亚型禽流感病毒一样,分离株NA基因有11个氨基酸缺失.此外,本研究还对分离毒株的受体亲和性进行了测定,结果显示该病毒优先结合唾液酸α-2,3 Gal受体.本研究结果表明A/Duck/Guangxi/F01/2016(H1N6)是一株重组低致病性禽流感病毒.

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