类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因的克隆、原核表达及其蛋白的生物信息学分析

       摘要: 试验旨在对类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因进行克隆与原核表达,并对其表达蛋白进行生物信息学分析.提取该菌基因组DNA作为模板,参考GenBank中类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因序列,设计1对引物.通过PCR扩增得到大小为1 641 bp的groEL基因片段,将其连接至pMD19-T载体,构建pMD19-T-groEL重组质粒,经BamH Ⅰ和HindⅢ双酶切鉴定正确后,构建重组质粒pET-28a(+)-groEL.将鉴定正确的pET-28a(+)groEL质粒转化至E.coli BL21(DE3)感受态细胞中,经IPTG诱导表达,运用SDS-PAGE和Western blotting方法进行蛋白质鉴定,利用DNAMAN和BioEdit等软件进行生物信息学分析.结果发现,试验成功克隆了类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因并进行了蛋白表达,表达的融合蛋白大小约为64 ku,GroEL蛋白的分子式为C4510H7381N1641O1840S521,原子总个数为15 893,消光系数为32 500,不稳定指数为40.31,亲水性平均值为0.901.GroEL蛋白二级结构中α-螺旋(Hh)、延伸链(Ee)、无规则卷曲(Cc)分别占48.71%、13.19%和38.10%.本试验结果为深入探究类鼻疽杆菌groEL基因的分子作用机理奠定了基础.

作者:
黄海峰 张振兴 杨小健 曹瑞勇 李宝宝 聂鑫 朱姝 李国华 彭冬梅 李亚颖 王凤阳 杜丽
单位:
海南大学热带农林学院动物科技学院,海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室,海口市动物基因工程重点实验室,海口570228
出处:
《中国畜牧兽医》
刊期:
2018年第45卷第2期
基金:
国家现代农业产业技术体系(CARS-38) 海南省重大科技计划项目(ZDKJ2016017-01)

类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因的克隆、原核表达及其蛋白的生物信息学分析

摘要:试验旨在对类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因进行克隆与原核表达,并对其表达蛋白进行生物信息学分析.提取该菌基因组DNA作为模板,参考GenBank中类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因序列,设计1对引物.通过PCR扩增得到大小为1 641 bp的groEL基因片段,将其连接至pMD19-T载体,构建pMD19-T-groEL重组质粒,经BamH Ⅰ和HindⅢ双酶切鉴定正确后,构建重组质粒pET-28a(+)-groEL.将鉴定正确的pET-28a(+)groEL质粒转化至E.coli BL21(DE3)感受态细胞中,经IPTG诱导表达,运用SDS-PAGE和Western blotting方法进行蛋白质鉴定,利用DNAMAN和BioEdit等软件进行生物信息学分析.结果发现,试验成功克隆了类鼻疽伯克霍尔德菌groEL基因并进行了蛋白表达,表达的融合蛋白大小约为64 ku,GroEL蛋白的分子式为C4510H7381N1641O1840S521,原子总个数为15 893,消光系数为32 500,不稳定指数为40.31,亲水性平均值为0.901.GroEL蛋白二级结构中α-螺旋(Hh)、延伸链(Ee)、无规则卷曲(Cc)分别占48.71%、13.19%和38.10%.本试验结果为深入探究类鼻疽杆菌groEL基因的分子作用机理奠定了基础.

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