芥菜型油菜多室基因Bjmc2的精细定位

       摘要: 芥菜型多室油菜的产量比普通两室油菜更高,定位乃至克隆多室基因可为油菜遗传改良及解释多室角果形成机制创造条件。本研究通过验证 JD11-2家系衍生群体仅在 BjMc2位点上存在差异,可用于 BjMc2的定位。采用AFLP结合BSA法分析BC5和BC6群体,筛选到1个与BjMc2连锁的AFLP标记并转化为SCAR标记SC1。基于该AFLP标记序列信息,利用白菜同源序列设计SSR引物和SCAR引物,获得11对SSR标记和1对SCAR标记。通过在芥菜型油菜 BAC 文库中的挑选,获得2个覆盖目标区域的单克隆,由此开发1个 SSR 标记。将获得的 SCAR 和SSR标记扫描BC7群体,构建了两室性状基因BjMc2的遗传连锁图,两侧最近标记ZX17和BACsr96与目标基因之间的遗传距离分别为0.048 cM和0.340 cM,并定位到白菜A7 Scaffold 000019的946~1014 kb之间,约68 kb物理距离。

作者:
王刚 张向向 徐平 吕泽文 文静 易斌 马朝芝 涂金星 傅廷栋 沈金雄
单位:
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 /国家油菜工程技术研究中心,湖北武汉,430070
出处:
《作物学报》
刊期:
2016年第42卷第12期
基金:
国家自然科学基金项目(31571698)资助

芥菜型油菜多室基因Bjmc2的精细定位

摘要:芥菜型多室油菜的产量比普通两室油菜更高,定位乃至克隆多室基因可为油菜遗传改良及解释多室角果形成机制创造条件。本研究通过验证 JD11-2家系衍生群体仅在 BjMc2位点上存在差异,可用于 BjMc2的定位。采用AFLP结合BSA法分析BC5和BC6群体,筛选到1个与BjMc2连锁的AFLP标记并转化为SCAR标记SC1。基于该AFLP标记序列信息,利用白菜同源序列设计SSR引物和SCAR引物,获得11对SSR标记和1对SCAR标记。通过在芥菜型油菜 BAC 文库中的挑选,获得2个覆盖目标区域的单克隆,由此开发1个 SSR 标记。将获得的 SCAR 和SSR标记扫描BC7群体,构建了两室性状基因BjMc2的遗传连锁图,两侧最近标记ZX17和BACsr96与目标基因之间的遗传距离分别为0.048 cM和0.340 cM,并定位到白菜A7 Scaffold 000019的946~1014 kb之间,约68 kb物理距离。

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