基于寡核苷酸探针套painting的小麦"中国春"非整倍体高清核型及应用

       摘要: 基于寡核苷酸探针套painting的染色体鉴定技术简单、经济和高效, 可以促进小麦品种及亲缘物种染色体识别和变异体鉴定, 提高染色体工程效率.我们前期开发了寡核苷酸探针套, 包含 pAs1-1、pAs1-3、AFA-4、(GAA)10和pSc119.2-1共5个探针.本研究通过一次荧光原位杂交(FISH), 对源于17个非整倍体的18份材料分析发现, 其中14个染色体组成正确, 可以清晰识别相应的缺体、四体和端体.还构建了基于寡核苷酸探针套涂染的、能准确识别3个基因组和7个部分同源群染色体的高清核型, 发现4个非整倍体发生变异, 其中从N5BT5D中鉴定出一个可能的小片段相互易位系T6AS·6AL-6DL和T6DS·6DL-6AL.进一步对7个地方品种、10个栽培品种(系)和1个人工合成小麦分析, 发现15条染色体存在多态性, 涉及6条B组(除4B)、5条A组(除1A和3A)和4条D组(1D、2D、4D和7D)染色体, 可以清晰识别我国小麦生产上广泛应用的3种易位类型(T1RS·1BL、T6VS·6AL 及相互易位 T1RS·7DL和T7DS·1BL), 省去了基因组原位杂交(GISH)程序.另外, 对5个亲缘物种分析发现, 该探针套可以识别栽培一粒小麦、硬粒小麦 Langdon、荆州黑麦、长穗偃麦草(2n=2x=14)全部和中间偃麦草30条染色体, 并构建了这5个物种的核型.本研究结果证实该寡核苷酸探针套可以有效用于小麦及亲缘物种染色体鉴定, 高清晰的中国春非整倍体核型为小麦染色体工程提供了参考标准.

作者:
王丹蕊 杜培 裴自友 庄丽芳 亓增军
单位:
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京,210095 山西省农业科学院作物科学研究所,山西太原,030030
出处:
《作物学报》
刊期:
2017年第43卷第11期
基金:
国家自然科学基金项目(31370385) 山西省农业科学院所长青年引导专项(yydzx09)资助

基于寡核苷酸探针套painting的小麦"中国春"非整倍体高清核型及应用

摘要:基于寡核苷酸探针套painting的染色体鉴定技术简单、经济和高效, 可以促进小麦品种及亲缘物种染色体识别和变异体鉴定, 提高染色体工程效率.我们前期开发了寡核苷酸探针套, 包含 pAs1-1、pAs1-3、AFA-4、(GAA)10和pSc119.2-1共5个探针.本研究通过一次荧光原位杂交(FISH), 对源于17个非整倍体的18份材料分析发现, 其中14个染色体组成正确, 可以清晰识别相应的缺体、四体和端体.还构建了基于寡核苷酸探针套涂染的、能准确识别3个基因组和7个部分同源群染色体的高清核型, 发现4个非整倍体发生变异, 其中从N5BT5D中鉴定出一个可能的小片段相互易位系T6AS·6AL-6DL和T6DS·6DL-6AL.进一步对7个地方品种、10个栽培品种(系)和1个人工合成小麦分析, 发现15条染色体存在多态性, 涉及6条B组(除4B)、5条A组(除1A和3A)和4条D组(1D、2D、4D和7D)染色体, 可以清晰识别我国小麦生产上广泛应用的3种易位类型(T1RS·1BL、T6VS·6AL 及相互易位 T1RS·7DL和T7DS·1BL), 省去了基因组原位杂交(GISH)程序.另外, 对5个亲缘物种分析发现, 该探针套可以识别栽培一粒小麦、硬粒小麦 Langdon、荆州黑麦、长穗偃麦草(2n=2x=14)全部和中间偃麦草30条染色体, 并构建了这5个物种的核型.本研究结果证实该寡核苷酸探针套可以有效用于小麦及亲缘物种染色体鉴定, 高清晰的中国春非整倍体核型为小麦染色体工程提供了参考标准.

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