摘要: 本文采用COI基因兼并引物对15种36个南极鱼类DNA进行扩增测序,并结合GenBank已有序列进行联配分析,对南极鱼2科22属43种共97条COI基因片段(539 bp)进行序列比较和系统发生关系研究,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性与可行性.结果分析表明,43种南极鱼科和鳄冰鱼科的鱼类COI基因的平均碱基组成为T:31.9%、G:18.3%、A:22.2%和C:27.6%,具有明显的碱基偏倚性.南极鱼类的种间平均距离为0.157,种内平均遗传距离为0.002,种间平均遗传距离是种内平均距离的79倍;系统分析结果显示,除南极小带腭鱼(Cryodraco antarcticus)和罗斯海小带腭鱼(Cryodraco atkinsoni)外,其余的鱼类皆能够形成独立的分支,且与形态学分支一致.由此可见,DNA条形码对南极鱼亚目鳄冰鱼科和南极鱼科鱼类能够进行有效的物种鉴定,基于COI基因所建的NJ(neighbor-joining)树对物种分类具有较为准确的辨识力.系统发生关系表明,DNA条形码可以对除南极小带腭鱼(Cryodraco antarcticus)和罗斯海小带腭鱼(Cryodraco atkinsoni)外的南极鱼物种进行鉴定,不仅可以作为形态学的辅助手段为南极鱼分类系统的必要补充和佐证,并且可以用于探讨南极鱼类近缘种的系统发育关系.
摘要:本文采用COI基因兼并引物对15种36个南极鱼类DNA进行扩增测序,并结合GenBank已有序列进行联配分析,对南极鱼2科22属43种共97条COI基因片段(539 bp)进行序列比较和系统发生关系研究,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性与可行性.结果分析表明,43种南极鱼科和鳄冰鱼科的鱼类COI基因的平均碱基组成为T:31.9%、G:18.3%、A:22.2%和C:27.6%,具有明显的碱基偏倚性.南极鱼类的种间平均距离为0.157,种内平均遗传距离为0.002,种间平均遗传距离是种内平均距离的79倍;系统分析结果显示,除南极小带腭鱼(Cryodraco antarcticus)和罗斯海小带腭鱼(Cryodraco atkinsoni)外,其余的鱼类皆能够形成独立的分支,且与形态学分支一致.由此可见,DNA条形码对南极鱼亚目鳄冰鱼科和南极鱼科鱼类能够进行有效的物种鉴定,基于COI基因所建的NJ(neighbor-joining)树对物种分类具有较为准确的辨识力.系统发生关系表明,DNA条形码可以对除南极小带腭鱼(Cryodraco antarcticus)和罗斯海小带腭鱼(Cryodraco atkinsoni)外的南极鱼物种进行鉴定,不仅可以作为形态学的辅助手段为南极鱼分类系统的必要补充和佐证,并且可以用于探讨南极鱼类近缘种的系统发育关系.
说明:如本页面涉及到版权问题或作者不愿意公开,请联系本站管理员删除!
[1] | 王征 . 南极地区极夜环境下预防骨量丢失的方法探讨 [J]. 中医正骨 ,2017,11 |
[2] | 付丹 郑晓玲 王保栋 辛明 滕芳 谢琳萍 . 南极半岛近岸海域生物化学要素分布特征及影响因素 [J]. 海岸工程 ,2017,1 |
[3] | 丁文祥 梁楚进 廖光洪 高立宝 . 南极普里兹湾海域湍流扩散系数估计 [J]. 海洋学研究 ,2017,1 |
[4] | 韩喜彬 章伟艳 杨海丽 初凤友 唐灵刚 许冬 葛倩 边叶萍 . 近百年来南极威德尔海北部水动力环境演变 [J]. 海洋学研究 ,2015,2 |
[5] | 何韵 杨木壮 . 南极半岛别林斯高晋海天然气水合物成矿条件与成矿机理 [J]. 海洋地质前沿 ,2018,4 |
[6] | 严俊丽 陈四清 常青 曹栋正 王贞杰 . 南极磷虾粉作为鲽形目鱼饲料蛋白源的营养价值评价 [J]. 渔业科学进展 ,2016,5 |
[7] | 赵敏 梁萌青 郑珂珂 徐后国 . 饲料中添加南极磷虾粉对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevi)雄性亲鱼繁殖性能及抗氧化功能的影响 [J]. 渔业科学进展 ,2016,6 |
[8] | 岳冬冬 王鲁民 黄洪亮 方海 王茜 纪炜炜 阮雯 肖黎 郑亮 . 基于专利视角的饲料中添加南极磷虾产品发展对策研究 [J]. 渔业信息与战略 ,2017,4 |